Peyton, die Deans Posten übernommen hat, stielt Vaughns Akten. Jack ist überzeugt, dass es etwas mit Prophet V zu tun hat und bittet Sydney daher sich mit Renee zu treffen. Doch Sydney ist überzeugt, dass Vaughn nichts in den CIA-Unterlagen hatte, dass im Zusammenhang mit Prophet V steht. Renee bestärkt sie bei ihrem Treffen darin. Während die beiden Frauen miteinander sprechen, werden sie plötzlich angegriffen und obwohl Renee zwei Angreifer abwehren kann, gelingt es ihnen Sydney zu entführen. Renee bleibt nichts anderes übrig als sich einen der an der Entführung der Beteiligten zu schnappen und sich mit Jack in Verbindung zu setzen. Gemeinsam versuchen sie Sydney zu finden, doch in dem angeblichen Versteck finden sie nur ein vollständig eingerichtetes Kinderzimmer.

Das Verhör dem Sydney unterzogen wird, entspricht nicht der üblichen Vorgehensweise. Der unsichtbarer Drahtzieher hinter einem durchsichtigen Spiegel ermahnt, dass dem Kind nichts geschehen darf und man ist auch offensichtlich darauf bedacht, dass Sydney keinen ernsthaften Schaden nimmt. Mit einer medikamentös erzeugten Hypnose versucht man eine bestimmte Erinnerung in Sydney zu wecken. Zu diesem Zweck sollen positive Erinnerungen in ihr wach zu rufen - Erinnerungen an Vaughn. Doch die Erinnerungen verselbständigen sich immer wieder. Schnell sind sich Sydney und Vaughn bewußt, dass man versucht Sydney zu manipulieren. Doch sie kommen nicht dahinter an was die Entführer interessiert sind. Schließlich finden sie sich in Sydneys Erinnerung wieder, in der Vaughn ihr zum ersten mal die Übersicht der SD-6-Zellen zeigt. Laut ließt sie einen Eintrag vor. Hinter dem Spiegel zeigt sich Irina zufrieden und weißt Peyton an dafür zu sorgen, dass es Sydney gut geht.

Sydney und Vaughn verabschieden sich voneinander in dem Wissen, dass ihrer Gegner eine falsche Information erhalten haben und in der Gewissheit, dass sie einander wiederfinden werden. Als Sydney zu sich kommt gelingt es ihr Peyton zu überrumpeln und zu fliehen. Doch als sie aus dem vermeintlichen Gebäude herausgefunden hat, muss die eine unschöne Entdeckung machen: sie befindet sich auf einem Containerschiff und weit und breit ist kein Land zu sehen.