Vaughn schafft es Sydney zu finden und wiederzubeleben. Zurück in Sienna erfahren sie, dass Peyton die Köpfe von Prophet Five ermordet hat und Sloane und seine Partner im Besitz von zwei Raketen sind. Sie wollen Teile Amerikas zerstören um am Wiederaufbau zu verdienen. Peyton, die APO verhaften konnte, verrät, dass Sloane sich in Mongolia aufhält. Vaughn, Sydney und Jack fliegen umgehend hin und Sydney kann den fast fertigen Prozess, den Sloane in Gang gebracht hat, unterbrechen und ihn erschießen. Jack wird dabei jedoch schwer verletzt. Als sie erfahren, dass Irina Sloanes Partner ist, bittet Jack Sydney, Irina das Handwerk zu legen und ihn zurückzulassen. Schweren Herzen verabschiedet sich Sydney von Jack. Dieser sammelt alle seine Kräfte und geht zurück in die Höhle in der Sloane in der roten Rambaldi-Flüssigkeit zusammengebrochen war. Wie von Jack erwartet, lebt Sloane. Triumphierend teilt er Jack mit, dass man ihm nun nichts mehr anhaben können - er ist unsterblich. Jack stimmt ihn zu und antwortet, dass er aber Sloane mit sich für immer in diese Höhle nehmen kann und löst eine Explosion aus. Sloane überlebt tatsächlich - halb unter einem Felsbrocken begraben und völlig bewegungsunfähig.

In Hongkong hindert Vaughn Sark daran die Raketen abzuschießen, während sich Sydney ihrer Mutter entgegenstellt. In dem Kampf zwischen ihnen wird Irina schließlich ihre eigene Gier zum Verhängnis. Anstatt Sydneys Hilfe anzunehmen, die sie trotz allem retten will, versucht sie nach der Rambaldi-Kugel zu greifen bis die Glasdecke unter ihr nachgibt.

Ein paar Jahre später sucht Dixon Sydney auf, um sie um Hilfe bei einem Auftrag zu bitten. Vaughn schlägt vor nach dem Abendessen darüber zu reden und gemeinsam noch ein bischen am Strand spazieren zu gehen und den Sonnenuntergang zu genießen. Sie rufen nach Isabelle, die im Nachbarzimmer die Holzteile das "Projekts Weihnachten" gefunden und problemlos zusammengesetzt hat...